先秦时期，属巴国。

秦汉时期，属巴郡枳县。汉和帝永元二年（90年），分置平都县，是为丰都建县之始。

蜀汉后祖延熙十七年（254年），平都县并入临江县，隶属巴郡。

隋恭帝义宁二年（618年），自临江县分置丰都县，隶属临州。

唐太宗贞观八年（634年），隶属忠州。唐玄宗天宝元年（742年），隶属南宾郡。唐肃宗乾元元年（758年），隶属忠州。唐昭宗乾宁二年（895年），荆南节度使成汭与部将许存溯江略地，武泰军节度使王建肇弃黔州（今重庆彭水），退保丰都，成汭部将赵武自黔州数攻丰都，王建肇不能守，降于王建。后唐明宗长兴初年（930），孟知祥部将朱偓攻打涪州（今重庆涪陵），武泰节度使杨汉宾弃黔南奔忠州，朱偓追至丰都，还取涪州。

宋徽宗政和元年（1111年），废县，并入临江县。宋高宗绍兴元年（1131年），复置丰都县，隶属忠州。

元世祖至元二十一年（1284年），垫江县并入丰都。元顺帝至正二十二年（1362年），明玉珍建立大夏政权，垫江县分出。

明太祖洪武十年（1377年），丰都县并入涪州。洪武十三年（1380年），自涪州分出复置，改名酆都，隶属忠州。

清圣祖康熙十三年（1674年），酆都县为吴三桂军占领。康熙十九年（1680年），清军收复。雍正十二年（1734年），隶属忠州。嘉庆七年（1802年），隶川东道忠州。

民国元年（1912年），隶四川省忠州；民国2年（1913年），隶四川行政公署川东道；民国3年（1914年），隶四川巡按使公署东川道；民国17年（1928年），直隶四川省；民国24年（1935年），隶四川省第八行政督察区。

中华人民共和国建立后，1950年，隶西南区川东行署区涪陵专区；1952年9月，隶四川省涪陵专区；1958年县名酆都改为丰都；1968年至1995年，丰都县隶四川省涪陵地区；1996年设立四川省地级涪陵市，丰都隶属涪陵市。

1997年12月，丰都县正式由重庆直辖市管辖。

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